蔬菜配送公司需要缴纳的税种主要包括以下几种：
增值税
蔬菜配送公司如果涉及蔬菜销售，则销售蔬菜部分免征增值税。
配送服务本身需要缴纳增值税，税率一般为6%。
运输蔬菜过程中可能涉及的其他服务，如仓储、装卸等，也可能需要缴纳增值税。
企业所得税
蔬菜配送公司作为一般纳税人，需要缴纳企业所得税，税率为25%。
如果企业符合小微企业的标准，实际税率可能为5%。
个人所得税
公司需要代扣代缴员工的个人所得税。
印花税
配送合同需要缴纳印花税，税率一般为万分之五。
城市维护建设税和教育附加税
根据增值税的金额，需要缴纳相应的城市维护建设税和教育附加税，具体比例分别为7%和3%。
地方教育附加税
类似于教育附加税，地方教育附加税的比例为2%。
土地使用税
公司可能需要缴纳土地使用税。
其他税种
根据企业的具体情况和行业分类，可能还需要缴纳其他税种，如代扣代缴员工个人所得税、房产税等。
建议
蔬菜配送公司在运营过程中应仔细研究相关税法规定，确保合法合规经营。
由于税率和税种可能因地区和行业而异，建议咨询当地税务机关或专业税务顾问，获取最准确的税务信息。
企业应合理规划财务和税务，以降低税负并提高经营效率。