违章停车被扣分的原因主要可以归纳为以下几点：
违反交通标志或标线指示
停车不入位、压线停车、故意斜停、跨位停放等行为，违反了道路交通标志或标线的指示，会被处以罚款并扣分。
停车时违反禁令标志或禁止标线指示，例如在公交站、加油站、消防门口等禁停区域停车，会被扣3分。
影响交通安全与通行秩序
逆向停车不仅违反停车规定，而且一旦启动车辆即为逆向行驶，容易引发交通事故，扰乱交通秩序，因此会被扣3分。
在交叉路口不按规定行车或停车，或在校车停靠站点不按规定停靠，会影响交通秩序和安全，一次性扣2分。
违反特定区域或情况下的停车规定
在高速公路或城市快速路上违法停车，会被扣9分。
在有明显禁止标志、标线的路段违法停放，会被扣3分，并处以200元罚款。
在非机动车道、消防通道等特殊区域停车，可能扣3分。
其他交通违法行为
驾驶与准驾车型不符的机动车，在高速公路或城市快速路上违法停车，会被扣9分。
驾驶机动车在高速公路或城市快速路上违法停车，还会被扣3分。
总结来说，违章停车被扣分的原因主要涉及违反交通标志或标线指示、影响交通安全与通行秩序、违反特定区域或情况下的停车规定，以及其他交通违法行为。不同的违规行为会有不同的扣分处罚。车主应严格遵守交通规则，避免违章行为的发生。